有些全身性疾病会伴有严重而迅速的牙周组织破坏。如Down综合征、糖尿病型牙周炎等。

Down综合征又名先天愚型，本病有家族性，是一种由染色体异常所引起的先天性疾病。患者智力低下，发育迟缓，面部扁平、眶距增宽，鼻梁低宽，颈部短粗，常伴有上颌骨发育不良。1／2的患者有先天性心脏病，15％的患儿于1岁前夭折。几乎所有的患者都患有严重的牙周炎，牙周破坏程度远远超过菌斑、牙石等局部刺激的程度。

患儿萌牙较晚，牙间隙较大，有明显的错牙合畸形，全口牙齿均有深牙周袋，尤以下颌前牙为重。可出现牙龈退缩，有的伴有坏死性龈炎。

目前人们普遍认为糖尿病型牙周炎是由于糖尿病降低了机体对牙周局部刺激因子的抵抗力所引起的。患者牙周炎较为严重，牙槽骨吸收迅速，经常出现牙周脓肿，病损以切牙和第一磨牙处较重，组织愈合非常缓慢。随年龄增长，病变可扩展到其他牙齿。

对于未被控制的糖尿病患者，不可进行复杂的牙周治疗。急性牙周感染需要切开引流时，应给予抗生素，并只作应急处理。只有在内科医生的合作下才能进行牙周病的复杂治疗。