肛瘘又称“肛门直肠瘘”，大部分肛瘘由肛门直肠脓肿破溃或切开排脓后形成。脓肿逐渐缩小，但肠内容物仍不断进入脓腔，在愈合缩小的过程中，常形成迂曲的腔道，引流不畅不易愈合，日久后腔道周围有许多疤痕组织，形成慢性感染性管道。

按瘘管与括约肌的关系分类：

（1）肛管括约肌间型：约占肛瘘的70％，多因肛管周围脓肿引起。瘘管位于内外括约肌之间，内口在齿状线附近，外口大多在肛缘附近，为低位肛瘘。

（2）经肛管括约肌型：约占25％，多因坐骨肛管间隙脓肿引起，可为低位或高位肛瘘。瘘管穿过外括约肌、坐骨直肠间隙，开口于肛周皮肤上。

①肛管括约肌上型：为高位肛痿，较为少见，约占4％。

②肛管括约肌外型：最少见。仅占1％。这类肛瘘常因外伤、肠道恶性肿瘤、Crohn病引起。治疗较为困难。

⑨其他：如直肠尿道瘘、直肠膀胱瘘、直肠阴道瘘等，较易与肛瘘鉴别。