男童生殖器红肿疼痛可能是由多种原因引起的，以下是一些常见的原因：

1. 感染：男童生殖器红肿疼痛可能是由于细菌感染、病毒感染或真菌感染引起的。

2. 过敏反应：男童生殖器红肿疼痛也可能是由于过敏反应引起的，例如过敏性鼻炎、过敏性皮炎等。

3. 其他疾病：男童生殖器红肿疼痛也可能是由其他疾病引起的，例如睾丸扭转、先天性畸形等。

4. 神经系统问题：男童生殖器红肿疼痛也可能是由神经系统问题引起的，例如神经纤维瘤等。

需要注意的是，这些原因并不一定都会导致男童生殖器红肿疼痛，具体原因还需要进行详细检查和诊断才能确定。建议及时就医，寻求专业医生的帮助。