精子畸形的诊断方法主要包括以下几种：

1. 显微镜检查：使用显微镜对精液进行观察，判断是否存在异常。

2. 细胞学检查：通过取精液样本进行细胞学检查，以确定是否存在不正常的细胞或组织。

3. 免疫荧光染色：使用免疫荧光染色技术，可以检测出某些特定的遗传物质或抗体。

4. 电镜检查：通过电镜观察精子形态和结构，判断是否存在异常。

5. PCR（聚合酶链式反应）检测：利用PCR技术对精液样本中的DNA进行检测，以确定是否存在遗传病等疾病。

需要注意的是，不同的诊断方法可能会有所不同，具体应根据患者的具体情况选择合适的方法进行诊断。