制霉素阴栓和克霉唑栓都是治疗阴道感染的药物，但它们在成分、药物种类和治疗疾病方面存在差异。具体如下：

1. 成分差异

制霉素阴栓的主要成分是制霉素，而克霉唑栓的主要成分是克霉唑。

2. 药物种类差异

制霉素阴栓属于广谱抗生素，能够杀死多种细菌，包括革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。而克霉唑栓则是一种抗真菌药物，能够杀死多种真菌，包括念珠菌和白色念珠菌等。

3. 治疗疾病差异

制霉素阴栓主要用于治疗细菌性阴道炎和念珠菌感染等疾病。克霉唑栓则主要用于治疗念珠菌感染和滴虫感染等疾病。

因此，制霉素阴栓和克霉唑栓在适应症和治疗对象上存在差异，选择使用时应根据具体病情和医生建议。在用药期间，应注意增加新鲜水果和蔬菜的摄入，避免摄入辛辣刺激、油腻和高糖食物。