清晨醒来时感到心慌心跳加速可能是由生理因素引起的，一般情况下无需特殊处理。然而，它也可能是低血糖或心律失常等病理因素的结果，需要根据具体情况进行药物治疗。以下是详细分析：

一、生理因素：

当早晨醒来后突然激活交感神经系统，导致儿茶酚胺类物质的突然释放，刺激窦房结，引起心慌、胸闷等症状。这是正常的生理现象，无需进行特殊处理，适当休息后通常可以自行恢复。

二、病理因素：

1、低血糖：

如果患有低血糖，早晨可能会出现心慌、心跳加速等症状。这是由于血液中的糖分偏低，对心脏交感神经造成刺激所致。轻度病例需要注意饮食调节，适当摄入饼干、巧克力等食物，可以改善不适症状。对于出现意识模糊等症状的患者，可以考虑静脉输注葡萄糖。

2、心律失常：

受心血管疾病或感染因素的影响，可能引起心跳加速、心慌和胸闷等症状，尤其在早晨时更为明显。建议咨询医生，使用富马酸比索洛尔片、盐酸普萘洛尔片、琥珀酸美托洛尔缓释片等药物进行治疗，以促进病情的恢复。

此外，这种情况也可能与心力衰竭等因素有关。一旦明确病因，应及时就医进行处理。