1、脑炎

约1000～10,000个病例中有1例发生脑炎。多发生在病程第3～8天，少数见于出疹前2周或出疹后3周。病情轻重不一，和脑脊液所见与一般病毒性脑炎相仿，病死率为5%～25%。其他少见的系统并发症有横断性脊髓炎、周围神经炎、视神经炎。

2、原发性水痘肺炎

多见于成人水痘患者和免疫受损者。轻者可无症状，或只有干咳，重者有咯血、胸痛、气急、紫绀和发热等。严重者可致命，尤其在妊娠中后期感染危险性更大。体征不明显。肺炎症状多见于出疹后2～6天，亦可见于出疹前或出疹后10天。诊断主要依靠X线，凭X线诊断有谓成人水痘中16%并发水痘肺炎，而有肺炎症状者只占4%。

水痘与Reye综合征常发生于水痘后期，伴呕吐、不安和激惹，进展到脑水肿，脑部的病理改变与高氨有关，由于阿司匹林也被认为与Reye综合征有关，因此国外认为水痘感染时最好禁用阿司匹林退热。心肌炎包括局部皮疹化脓性继发感染、蜂窝组织炎、急性淋巴结炎、丹毒。

近年来美国报道水痘患儿并发甲组链球菌感染(InvasiveGroupAstreptococcusGAS)，多发生于出水痘的第3～6天时，可表现为局部红肿的蜂窝组织炎，或者链球菌性休克样综合征(Streptococcaltoxicshock-likesyndromeISLS)，均病情危重，病死率较高，需特别注意及时采取防治的措施。