胚胎移植后，腹部两侧出现偶尔的疼痛可能有生理和病理因素导致。下面对这些因素进行具体分析：

一、生理因素：

胚胎移植通常是采用体外受精的方式，将胚胎组织移植到子宫内，以实现妊娠的目的。移植后，机体会为了维持胚胎的正常发育而迅速增加黄体功能，这可能会压迫卵巢组织，导致腹部两侧偶尔疼痛。这种情况属于正常生理现象，通常无需特殊治疗。

二、病理因素：

1. 输卵管炎：

输卵管炎可能由需氧菌、厌氧菌等感染引起。在炎症因子的刺激下，输卵管可能会出现症状，其中包括腹部两侧的疼痛。对于输卵管炎，可以遵医嘱使用盐酸左氧氟沙星胶囊、头孢克肟胶囊等药物进行治疗。

2. 卵巢囊肿：

卵巢囊肿可能由激素水平失调、遗传因素等影响引起。在这些因素的刺激下，卵巢组织可能形成囊性结构。随着囊肿体积逐渐增大，可能会影响周围器官组织，导致腹部两侧出现疼痛。对于卵巢囊肿，建议及时前往正规医疗机构，进行囊肿切除手术进行治疗。

此外，胚胎移植后腹部两侧疼痛也可能是急性胃肠炎、急性阑尾炎、子宫内膜炎等问题导致的。在接受治疗期间，建议积极配合医生的治疗和建议。