预防肛瘘疾病的方法有：

一、膳食平衡避免湿热：从医学角度而言，肛瘘的发生与体内湿热有着莫大的关系，因此，在日常生活饮食中，需要警惕油腻饮食，避免因此而内生湿热。适宜吃清淡的、富含维生素的食物，蔬菜类有如萝卜、冬瓜等，蛋白质类有如瘦肉等。

二、肛门出现不适时及时治疗，若本身已患克隆氏病、溃疡性肠炎等疾病者，应该积极治疗，以免引发肛周脓肿者;另外，出现如肛门灼热不适，肛门下坠者需要及时诊治。

三、防治便秘和腹泻，便秘者一般因大便干结而排便不顺，容易擦伤肛窦，也容易让细菌侵入感染;腹泻者多数因为直肠炎或肛窦炎而致，长时间腹泻会令炎症更为严重。

四、养成良好的排便习惯：每次排便后，注意肛门处的清洁，不要用劣质的卫生纸，也不要大力的拭擦。