由于鼻咽癌的症状特异性并不是很强，不少颈部和颅内的病变如颈部原发性肿瘤、颈淋巴结核、颈淋巴结炎、神经源性恶性肿瘤等也可能出现相类似的症状，临床上应注意相互鉴别。

颈部原发性肿瘤：如恶性淋巴瘤，好发于青壮年男性。可发生于全身各组织器官的淋巴组织，但以颈部、腋窝、腹股沟、纵隔及腹部淋巴结最为多见，尤以浅表淋巴结肿大为显著。当恶性淋巴瘤发生在颈部时，需与鼻咽癌相鉴别。

颈淋巴结核：好发于青少年，但其肿大的淋巴结较软，可与周围组织粘连成块，触诊时可有波动感，穿刺可抽吸出干酪样物质。

颈淋巴结炎：可由咽部或牙齿疾病引起，多位于颌下。如中年及老年人在颈部或副神经链处有较硬的淋巴结时，须引起警惕，要及时排除肿瘤转移的可能。

神经源性恶性肿瘤：主要包括神经纤维肉瘤和神经纤维瘤恶变，前者常与丛状神经纤维瘤或神经纤维瘤同时发生，后者多由丛状神经纤维瘤和神经纤维瘤病发生。虽然该病发生在颈部的情况比较少见，但一旦发生便会具有该病的特点即肿块迅速生长，常向周围组织侵犯，可出现局部疼痛，触之肿块质硬，患者的颈部不能活动或活动受限。需与鼻咽癌相互鉴别。