孕12周出现小便擦拭时有褐色分泌物，可能是由于激素变化引起的生理原因。这种情况通常属于正常现象。然而，也有可能是病理性原因导致的，例如先兆流产、妇科炎症等。根据具体情况，需选择适当的治疗方法。

一、生理原因

怀孕后，体内激素水平发生显著变化，刺激子宫可能导致阴道轻微出血，呈现为少量褐色分泌物。如果没有腹痛、发热等症状，一般无需过于担心。但仍应保持关注身体状况，及时到医院进行产检。

二、病理原因

1、先兆流产

如果孕12周出现小便擦拭时有褐色分泌物，并伴随腹痛、阴道少量出血，可能是先兆流产的迹象。这时应前往医院进行B超检查。在医生的指导下，可以采用地屈孕酮片、黄体酮胶囊等药物进行保胎治疗。

2、妇科炎症

怀孕后，由于免疫力下降，个人卫生不注意可能导致妇科炎症，如阴道炎、宫颈炎等。这些情况会引起阴道轻微出血，通常呈现为褐色分泌物，并伴有瘙痒症状。在医生的指导下，可以使用高锰酸钾洗液，同时配合保妇康栓等药物进行治疗。

此外，孕12周出现小便擦拭时有褐色分泌物，也可能是异位妊娠所致，此时应前往医院进行详细检查，并积极接受治疗。

总之，对于出现上述情况，建议及时就医，根据医生的建议选择合适的治疗方法。保持良好的个人卫生，平时多注意身体变化，可以有效预防一些妇科问题的发生。