男性阴茎上长小肉粒的原因可能有很多种，以下是一些常见的情况：

1. 阴茎疣：这是一种常见的皮肤病，通常在生殖器周围出现小肉粒。它们通常不会引起任何疼痛或不适。

2. 真菌感染：真菌感染也可能导致阴茎上出现小肉粒。这种情况通常需要治疗，并且需要使用抗真菌药物。

3. 疱疹：疱疹是一种由病毒引起的感染，通常会在生殖器周围出现小肉粒。它们通常不会引起疼痛或不适。

4. 其他疾病：其他疾病也可能导致阴茎上出现小肉粒，例如淋巴结炎、肿瘤等。

如果你发现自己有阴茎上出现小肉粒，建议去看医生进行检查和诊断。医生可以根据症状和体征来确定具体的病因，并制定相应的治疗方案。