长期侧睡一侧可能引起肩胛骨疼痛的原因可能有多种，其中包括睡姿不当、肌肉疲劳以及肩周炎等因素。具体分析如下：

1、不良睡姿

使用过高或过硬的枕头可能使头部抬高，导致颈椎过度弯曲，肩膀也会变得僵硬，从而增加肩胛骨疼痛的风险。为了减轻疼痛，睡觉时最好选择适合自己身体需求的枕头，保持颈部和肩部的放松。

2、肌肉劳损

长时间保持同一姿势会导致肩胛骨周围的肌肉、韧带和关节等结构出现劳损和疲劳感，从而引发肩胛骨疼痛。如果情况严重，建议患者前往医院，按照医生的建议服用药物如尼美舒利胶囊、双氯芬酸钠缓释片等来缓解症状。

3、肩周炎

长时间侧卧可能对肩部的软组织施加压力，导致肩袖肌腱损伤，从而引起肩周炎和肩胛骨疼痛。在医生的建议下，患者可以短期内使用非甾体类抗炎药来缓解疼痛，常用的药物有布洛芬缓释片、依托考昔片等。

除上述因素外，肩胛骨疼痛还可能与神经受压、神经根型颈椎病、肋骨骨折等有关。如果肩胛骨疼痛持续或加剧，建议及时就医检查和诊断，并根据医生的建议选择适当的治疗方式，以免病情进一步恶化。