男性生殖器上长小水泡的原因可能有很多种，以下是一些常见的原因：

1. 过敏反应：如果男性在生殖器上长了水泡，可能是由于他对某种物质过敏或者接触到了某种刺激物。

2. 疱疹：疱疹是一种常见的性传播疾病，它通常会导致男性生殖器上出现水泡。

3. 细菌感染：细菌感染也可能导致男性生殖器上出现水泡。例如，淋病和梅毒等病毒感染都可能引起这种情况。

4. 其他疾病：有些疾病也可能导致男性生殖器上出现水泡，例如淋巴瘤、肺结核等。

如果男性发现自己有小水泡，最好去看医生进行检查和诊断。医生可以通过检查来确定水泡的原因，并给予相应的治疗建议。