大拇指指甲凹陷可能由多种内外因素引起。在内因方面，严重的贫血、心肺疾病以及肢体末端血液循环障碍可能导致指甲甲母质局部供血供氧不足、营养缺乏，进而影响甲母质合成甲板的功能，导致指甲凹陷。此外，缺乏某些维生素和微量元素，如钙和锌，也可能导致指甲凹陷。外因方面，指甲本身可能受到外伤或挤压等因素的影响而出现凹陷，另外，皮肤癣菌的真菌感染破坏了甲板，也可能导致指甲凹陷，这可以通过进行真菌检查来明确诊断。

缺铁性贫血引起的指甲凹陷需要增加含铁食物的摄入，并补充叶酸和维生素B12。对于由免疫性疾病引起的指甲凹陷，主要治疗应集中在治疗原发疾病上，一旦疾病康复，指甲凹陷情况就会改善。

对于由真菌感染引起的指甲凹陷，可以外用土槿皮煎水进行治疗，但禁止内服，因其具有毒性。需要强调的是，指甲凹陷的病因有很多，应在医生的指导下进行治疗，切勿盲目使用药物。希望这篇回答对您有所帮助！