当三个月大的宝宝在睡觉时突然大哭，可能是由生理因素或疾病因素导致的，例如维生素D缺乏性佝偻病或婴儿肠痉挛等。具体分析如下：

一、生理因素

随着宝宝身体的生长发育，他们的日常饮食量也会逐渐增加。有时候，在睡觉前喝的奶可能不够多，这会导致饥饿感而引发突然的哭闹。这属于正常的生理原因，不必过于担心。

二、病理因素

1、维生素D缺乏性佝偻病

在宝宝的发育期间，如果没有及时为他们补充维生素D，就可能导致严重缺乏这种营养物质，进而引发维生素D缺乏性佝偻病。这会间接地增加宝宝的神经兴奋性，并伴随着枕秃、多汗等症状。建议在日常生活中适当补充维生素D，有助于控制佝偻病的畸形程度。

2、婴儿肠痉挛

婴儿肠痉挛的原因尚不明确，可能与胃肠动力异常、肠道菌群失调或乳糖不耐受等有关。常见症状包括宝宝突然哭闹、烦躁、握紧拳头等。建议给宝宝适量饮用温水，并轻揉腹部以缓解症状。

除了上述常见原因，宝宝的突然哭闹也可能与肠炎或发热等问题有关。