怀孕期间若发现卵巢囊肿，治疗方法应根据囊肿的大小和性质进行确定。建议尽早前往医院就诊，进行必要的检查后积极采取治疗措施。

对于怀孕患者而言，首先应进行肿瘤五项检查，以评估卵巢囊肿的良性或恶性程度。如果卵巢囊肿的体积较小，且没有快速增长的趋势，通常被认为是良性的。此时，可以选择暂时不进行治疗，但需要定期复查。若考虑到囊肿大小超过五公分，可以在孕14周后考虑进行囊肿剥除手术，并将切除的囊肿送病理检查，术后需进行安胎治疗。然而，若卵巢囊肿的体积较大，并且在短时间内迅速增长，就需要考虑是否存在恶性病变或囊肿破裂、囊肿蒂扭转等情况，此时需要进行手术治疗。

通常情况下，最适宜摘除卵巢囊肿的手术时间为妊娠16~24周。此时，子宫相对稳定，不易引发流产或早产等并发症。在手术过程中，应使用胎儿保护药物来抑制子宫收缩，并进行病理检查。