虹膜囊肿分为原发性和继发性两种类型:

原发性虹膜囊肿可发生在虹膜色素的上皮层或基质层。

继发性虹膜囊肿可由眼内手术、眼外伤、缩瞳剂长期滴注、炎性渗出、寄生虫感染等引起，其中以外伤性植入最常见，由结膜或角膜上皮通过伤口进入前房并生长于虹膜内引起。虹膜囊肿可长至后房，瞳孔区见虹膜后有黑色肿块，易误诊为黑色素瘤。囊肿增大时，占据前房或阻塞前房角。

目前虹膜囊肿主要采用激光或手术治疗。