跑步后小腿肌肉酸痛，采取以下措施进行治疗:

一是可以热敷，比如在酸痛的肌肉上放一块热毛巾，可以缓解肌肉酸痛。

其次可以用外用药治疗，主要是具有活血化瘀止痛作用的中成药，效果不错。

第三，可以做局部理疗，可以放松肌肉和筋膜，缓解疼痛。

最后可以做按摩，也可以放松肌肉和筋膜，缓解肌肉酸痛。如果病人有条件，可以去医院。医生会检查病人的情况，然后决定采取什么样的方案。