男性少精子症的原因在临床上还不得而知，但有两种情况可以考虑。

一、生精低下，睾丸略小或与生精有关的激素，如卵泡雌激素，相对较高。此时认为是睾丸功能所致的生精功能低下。精子低可以查出遗传背景，有时候查不出来，比如Y染色体微缺失，克雅氏病等。这是精子发生率低引起的少精子症。

二、不完全梗阻引起的少精子症，如果完全梗阻可能导致少精子症，不完全梗阻可能导致少精子症，可发生在附睾或射精管水平。对于不完全梗阻引起的少精子症，有的人可以尝试手术矫正，但要慎重。有时候手术矫正不好，本来就是少精子症，但是如果矫正后出现新的损伤，就会导致少精子症。

对于精子发生率低或原因不明的少精子症，可以使用相应的药物治疗，但药物治疗有一个周期。因为精子发生周期平均在三个月左右，当然也有研究证实一个精子最快40多天就能出来，但大部分在概念上是平均三个月左右。所以少精子症的治疗要有耐心，大概需要3-6个月，根据治疗的反应调整治疗方案。