子宫内膜异位症恶变率约为1%，主要恶变部位在卵巢，称为与子宫内膜异位症相关的卵巢恶性肿瘤。其他部位，如阴道和直肠隔、腹壁或会阴切口，子宫内膜异位症恶变相对较少。

目前的研究表明，子宫内膜异位症可增加卵巢上皮癌的风险，如卵巢子宫内膜样癌和透明细胞癌。临床上，我们应该警惕子宫内膜异位症的恶性转化，如果:

绝经后子宫内膜异位症患者疼痛节律的变化。

第二个卵巢囊肿太大，直径超过10cm。

第三次影像学检查发现卵巢囊肿为实性或乳头状结构，彩色多普勒超声检查显示病变血流丰富，阻力低。

第四血清CA125水平过高，超过200U/ml，感染除外。

因此，重视子宫内膜异位症的早期诊断和治疗是防止恶变的最佳策略。