咽口水时喉咙右侧疼，可能和以下原因有关:

1.可能是扁桃体炎。扁桃体炎发作时，炎症刺激咽喉，饮水后疼痛。

2.一些患有急性咽炎、慢性咽炎等疾病的患者，也会出现咽痛的症状。

3.不能完全排除其他疾病。比如急性会厌炎或会厌炎脓肿后，也可能出现吞咽和咽痛的症状。需要了解病因，然后对症治疗。