阴茎根部长痘的可能原因主要有以下几种:

第一，可能是阴茎珍珠疹引起的痘痘。这种情况往往没有痛或痒的感觉，对人的健康没有危害。属于生理发育异常，一般不需要治疗。

第二，也有可能阴茎根部粉刺是生殖器疱疹引起的，可能是不洁性接触引起的。建议需要抗病毒治疗。

第三，可能是过敏引起的阴茎根部长痘，常伴有严重的瘙痒、溃烂等症状。要及时进行抗过敏、抗炎治疗。