拇指指甲长到肉里了，要去除病因，对症治疗。具体的处理方法包括以下几个方面:

1.拔出钉子。

2.在炎症期，如果已经形成甲沟炎或甲沟脓肿，就要切开脓肿或应用抗生素。同时，脚部需要通风。

3.如果有真菌感染，需要抗真菌治疗。没有抗真菌治疗，盲目手术容易导致真菌的传播。