局部口腔疾病是引起口臭的主要原因，但不可忽视的是，口臭往往是一些严重全身性疾病的口腔表现，一些器质性疾病也会导致口臭。

口腔口臭:据统计，80% ~ 90%的口臭来自口腔。未处理的龋齿、残根、残冠、修复不良、解剖结构异常、牙龈炎、牙周炎、口腔黏膜疾病等都会引起口臭。龋齿和牙周病是最常见的相关疾病。食物残渣和牙菌斑经常留在深洞和不良修复的突出物下，细菌通过发酵分解，产生臭味。牙髓坏死或化脓性牙髓炎不治疗可散发臭味；牙周病患者常伴有大量牙石和牙菌斑，牙周袋内的细菌发酵产生硫化氢、吲哚和氨，从而产生臭味。此外，牙周脓肿、牙周袋脓溢，多为金黄色葡萄球菌合并牙周致病菌感染所致，也会散发异味。唾液的质量和数量也起着重要的作用。唾液量减少，蛋白质等有机成分增加，降低了唾液的冲刷缓冲作用，导致细菌大量滋生，分解唾液、龈沟液、食物残渣中的有机成分，产生大量挥发性硫化物、吲哚等物质，产生口臭。

非口腔性口臭:口腔邻近组织疾病，如化脓性扁桃体炎、慢性上颌窦炎、萎缩性鼻炎等。，可产生脓性分泌物并散发臭味；急慢性胃炎、消化性溃疡等临床常见内科疾病有酸臭味；幽门梗阻、胃癌晚期常导致臭鸭蛋口臭；糖尿病酸中毒患者可呼出丙酮味气体，尿毒症患者可呼出烂苹果味。此外，白血病、维生素缺乏、重金属中毒等疾病都会引起口臭。

生理性口臭:饥饿、食用一些药物或葱、蒜等刺激性食物、吸烟、睡眠时唾液分泌减少导致细菌分解的大量食物残渣，都可能引起一过性口臭。健康人的口臭可能是由于不良的口腔习惯和口腔卫生造成的舌背菌斑增多、增厚所致。由于舌背表面积大，乳头、裂隙、凹陷多，有利于细菌、口腔黏膜脱落上皮、食物残渣等滞留。，并充当“细菌储藏室”，有利于口臭的产生。研究表明，口臭的程度和挥发性硫化物的量与舌苔的厚度和面积呈正相关，尤其与舌苔的厚度呈正相关，去除舌苔后挥发性硫化物减少。这可能是因为舌苔越厚，越容易形成厌氧环境，更有利于厌氧菌的生长，从而更有利于挥发性硫化物的产生，导致口臭。