甲状舌骨囊肿手术风险不大，主要风险可能如下:

首先，少数患者可能有异位甲状腺，可能在甲状舌骨囊肿手术中受损。

其次，手术过程中可能会损伤供应甲状腺的血管，导致术后甲减。

第三，甲状舌骨囊肿手术过程中，可能损伤邻近颈部血管，造成术中出血。

第四，甲状舌骨囊肿术后可能发生切口感染。因为一般情况下，这个手术的切口是异种切口，术后不能使用抗生素。