金匮肾气丸与六味地黄丸的区别在于:

1.成分:金匮肾气丸含有地黄、山药、山茱萸、茯苓、牡丹皮、泽泻、桂枝、附子、牛膝和车前子；六味地黄丸含有熟地黄、吴茱萸、牡丹皮、山药、茯苓、泽泻。

2.功能:金匮肾气丸温肾阳，化气为水，用于肾虚水肿，腰膝酸软，小便不利，畏寒肢冷；六味地黄丸滋养肾阴，用于肾阴不足，头晕耳鸣，腰膝酸软，骨蒸潮热，盗汗遗精，消渴。

3.不良反应:金匮肾气丸尚不清楚；六味地黄丸可能出现腹泻、腹痛、腹胀、恶心、呕吐、胃肠不适、食欲不振、便秘、瘙痒、皮疹、头痛、心悸、过敏等不良反应。