造血干细胞移植会导致感染、移植物抗宿主病、肝肾功能障碍、移植后淋巴增生性疾病、渗漏综合征、血栓性微血管病等并发症。

感染是造血干细胞移植后最常见的并发症之一，包括细菌感染、真菌感染和病毒，尤其是EB病毒和巨细胞病毒。

移植物抗宿主病包括急性移植物抗宿主病和慢性移植物抗宿主病，发病率很高。

此外，移植过程中使用的许多药物对肝肾功能有损害，可引起肝肾功能损害。

因此，造血干细胞移植存在多种并发症，需要医生积极判断和治疗。