大腿根部两侧疼痛可考虑以下原因:

一、泌尿系结石患者，如输尿管中下段、泌尿道结石，会出现大腿根部放射性疼痛，患者还会出现尿痛、血尿等症状，一般可以通过泌尿系统的彩超进行鉴别。

二、长时间不运动，突然运动量过大，导致大腿根部乳酸堆积，大腿根部疼痛的症状也会出现。

三、运动前热身不充分会导致运动中大腿根部肌肉拉伤或腹股沟韧带拉伤，也会出现大腿根部疼痛的症状。