阴茎根部有包的原因包括:

1.可能是阴茎根部血管扩张，导致类似于局部血管瘤和血管畸形的表现。

2.该患者有尿道成形术史。

3.可能是尿道稀释导致的表现。

4.可能是尿道周围皮脂腺发炎感染。

5.有阴茎硬结的可能。

阴茎根部出现隆起，建议患者听从专科医生的指导进行相应的检查和治疗。根据专科医生的意见，做出适当的处理。