目前甲状腺癌的分期主要基于美国癌症联盟的甲状腺癌TNM分期。其中T指原发病灶的大小；n指是否有区域性淋巴结转移；m指有无远处器官转移。

T1表示肿瘤直径小于两厘米，肿瘤位于甲状腺；

T2指的是两到四厘米长的肿瘤，位于甲状腺内；

T3指肿瘤大于4 cm，但局限于甲状腺或任何大小并侵犯颈前肌的甲状腺癌；

T4是指侵犯甲状腺包膜的任何大小的肿瘤，如神经、气管、前筋膜、皮肤等；

N0一般表示无区域性淋巴结转移；

N1指区域淋巴结转移；

M0意味着没有遥远的转移；

M1指的是远处器官的转移。

一般来说，甲状腺乳头状癌和滤泡状癌预后较好，甲状腺髓样癌不如甲状腺乳头状癌好。甲状腺未分化癌在临床上较为罕见，是一种恶性程度较高、预后较差的肿瘤。平均存活时间为3至6个月，一般一年生存率仅为5至10%。