肝囊肿通常不会自愈。

肝囊肿是一种先天性疾病，主要的疾病理论是肝脏内的胆管细胞发生性状改变。

肝囊肿如果不是外界因素刺激或遗传因素决定的，可能是单发或终身小发，不需要任何药物干预或手术治疗。患者没有必要因为肝囊肿而过度恐慌。

而较大的肝囊肿，如数量和体积较大，则需要根据患者的病情和身体状况进行内科治疗甚至外科治疗。

所以肝囊肿虽然不能自愈，但大部分患者一生都没有特别的不适。