跑步时，外侧膝盖最常见的疼痛是运动过度。临床上常见患者运动、跑步，喜欢爬山，同时又喜欢下蹲，导致膝盖外侧疼痛。

膝盖的外侧结构，第一个是半月板。比如，如果患者是盘状半月板，就会有外侧痛。因为是先天性的，摩擦多了会有疼痛感。

还有的患者膝盖外侧胫腓骨关节疼痛，是运动过度引起的，下蹲时也有。治疗很简单，热敷加一点外用药，就能缓解。对于非常严重的患者，要做核磁共振来看严重程度。必要时可采取口服药物或局部封闭来解决问题。

有的患者很严重，半月板损伤已经影响了功能，也会有疼痛。需要做一个关节镜，修复半月板，让患者解决相关问题。如果发现下肢的力线是外翻膝引起的疼痛，可能需要截骨术来解决。

以上内容需要骨科医生判断，才能得到满意的结果。