1.亚急性甲状腺炎早期很难鉴别。甲状腺部分逐渐或突然疼痛肿胀，有病毒感染和发热史。严重者表面皮肤出现红斑、发热，轻至中度甲状腺肿(常为不对称)，不侵犯邻近组织。甲状腺明显压痛，急性期血沉加快，甲状腺功能增强，碘吸收率降低，甲状腺毒症，罕见的白细胞增多。阿司匹林常可缓解症状，类固醇激素效果较好，常为自限性，持续数周至数月。它不需要手术治疗，并可能有暂时的甲状腺功能减退。发热、白细胞增多、核左移、甲状腺功能正常提示急性甲状腺炎的诊断。超声和CT的应用有助于脓肿的早期发现和明确诊断。

2.急性感染性疾病:急性化脓性淋巴结炎、传染性甲状舌管或鳃裂囊肿、甲状软骨病、前颈部蜂窝织炎或脓肿、路德维希氏咽峡炎(化脓性颌下腺炎)、咽后间隙脓肿和甲状软骨炎。

3.恶性肿瘤快速生长的未分化甲状腺癌临床表现与AST相似，表现为颈前区疼痛、压痛、发热、呼吸困难。当诊断年龄较大，甲状腺右叶受累，病变较广，贫血，甲状腺穿刺液无菌培养，抗生素不能改善症状时，应怀疑恶性肿瘤。甲状腺活检组织学检查可明确诊断。转移癌、未分化甲状腺癌和食道癌可因肿瘤坏死或瘘导致甲状腺部位出现AST样表现，喉癌伴软骨侵犯。

4.甲状腺腺瘤、囊肿或甲状腺癌引起的急性出血。