1.急性肾盂肾炎还表现为发热、尿频、尿急等膀胱刺激症状，并伴有脓尿和腰痛。但无阴道毛滴虫感染史，起病急，症状明显。尿液中有致病菌株，但涂片染色未发现滴虫。

2.肾结核还表现为反复尿频、尿急、尿痛、脓尿，并伴有低热，但肾结核患者往往同时有肺结核病史。没有浆液性或脓性阴道分泌物。涂片染色找不到滴虫，尿沉渣涂片抗酸染色可找到抗酸杆菌。

3.淋菌性尿道炎发病初期，尿道口也有瘙痒、红肿、刺痛，并伴有尿频、尿急、尿痛。尿道里有稀薄的粘液分泌物。但此病有明显的尿痛，大量尿道分泌物，可逐渐演变为脓性分泌物。一般有不洁性交史。尿道分泌物或尿液中找不到滴虫，但可以找到淋球菌。

4.慢性细菌性前列腺炎表现为尿频、尿急、尿末痛、小腹、会阴、睾丸疼痛，与滴虫性前列腺炎症状相似。然而，患者没有不洁性交史，没有尿道分泌物或偶尔尿道滴漏。直肠指检显示前列腺硬，轻度压痛。尿常规检查一般没有脓和白细胞，前列腺液常规检查也查不出滴虫。据此可以认定。

5.急性膀胱炎还表现为尿频、尿急等膀胱刺激症状。但起病急，症状明显；或者阴道、尿道分泌物少，尿液、分泌物涂片染色查不出滴虫。

6.膀胱结核还表现为反复尿频、尿急、尿痛、脓尿。但患者往往同时有肾脏或肺结核病史；但没有浆液性或脓性阴道分泌物。涂片染色找不到滴虫，尿沉渣涂片抗酸染色可找到抗酸杆菌。