脑干损伤的后遗症会受到患者自身的身体状况、损伤的形式、治疗的效果以及许多外部和内部环境因素的影响。所以治疗方法要根据每个人的具体情况来选择。目前，医学上通常采用细胞渗透疗法治疗脑损伤。

脑干损伤后遗症的主要原因是脑血流量增加，各种原因引起的二氧化碳积聚，颅内血管挤压变形，血管瘤引起的颅内血压升高。患者颅骨变形也是后遗症的原因之一。有些外伤或先天原因是颅腔变小，使某些组织受到压迫，无法完成正常的生理功能。此外，颅内占位病变、脑脊液增多、脑水肿都是可能造成脑干损伤后遗症的原因。

脑干损伤的明显表现是患者嗜睡，难以醒来。这种情况不是睡觉而是轻度昏迷，四肢经常抽搐。这是脑干细胞被刺激发生一些癫痫发作的表现，严重的抽搐甚至导致癫痫。患者常有瞳孔散大，有时两侧瞳孔大小不一，患者还出现心跳缓慢、精神躁动、精神障碍等情况。

具体来说，患者会出现脑损伤和失语症，这是由于语言中枢的损伤。有时，患者会患有失认症，这是一种罕见的情况。虽然病人能描述一些物体或人，但不能说出这些东西的名字。其他常见的后遗症有失眠、头晕、乏力等。

对于患者后遗症的治疗，往往治疗周期长，效果不明显，治疗手段复杂。病人家属应该了解治疗的信息。家属要时刻支持患者，坚定治疗信心。脑损伤患者要注意饮食，补充维生素、叶酸、钙、镁等微量元素。尽量去大医院正规治疗，不要偏方。当病人出现呕吐、腹泻时，要注意补充病人的水分和电解质。