高位肛瘘和低位肛瘘的区别在于瘘管在括约肌的位置判断。

因为肛瘘是一种管状结构，由直肠内部的内口和皮肤外部的外口连接而成。

这种连接是走直线还是曲线，甚至是转很多圈，都是不确定的。通过肛周超声或直肠磁共振成像，可以发现瘘管的病程。如果瘘管穿过肛门周围的括约肌，甚至高于肛门周围的括约肌，就是高位肛瘘。如果瘘管在括约肌下，甚至在皮肤下，就是低位肛瘘。

这两种肛瘘之所以不同，是因为治疗方法完全不同。高位肛瘘要保证患者能够根治，同时最大限度的保留肛门功能。