深部肛门疼痛被认为是由高位肛周脓肿、高位肛瘘和肛窦炎引起的。

高位肛周脓肿通常表现为肛门深部疼痛，主要是深部细菌感染所致。也可伴有发热、寒战等症状。

高位肛瘘也会引起肛门深处的疼痛。因为肛瘘发炎，还会分泌大量的脓性分泌物，刺激肛门深处的组织，引起肿胀、疼痛、流脓。

肛窦炎还会引起肛门深部疼痛，主要是肛门隐窝细菌感染引起的。如遇肛门深部疼痛，需及时到医院肛肠科完善相关检查，明确诊断，对症治疗。