肺炎球菌脑膜炎发生在原发病后一周以上，颅脑外伤继发者可在10天至一个月以上。临床表现包括原发病和脑膜炎。该病起病急，有发热、剧烈头痛、呕吐、全身无力、意识改变、颈部阻力、阳性脑膜刺激征如切尔尼征、布鲁津斯基征、颅内高压。皮疹不常见，有时皮肤或粘膜上出现小出血点，在形态上与流行性脑脊髓膜炎的瘀点不同，广泛的瘀点和瘀点较少。与成人不同，婴儿肺炎球菌脑膜炎的特点是极度易怒、惊厥、嗜睡、厌食、喷射性呕吐，有时角弓倒转。囟门膨出常可在体检中发现，但在呕吐、失水严重者不明显。老年患者脑膜刺激症状不明显。继发于中耳炎、乳突炎等的脑膜炎患者。，往往发展迅速，并可能很快出现意识障碍。这种疾病通常因病情严重、诊断过晚或治疗不当而变得复杂。常见的并发症包括硬膜下积液、子宫积脓或脑积水。二是脑神经损害，主要累及动眼神经、面神经、滑车神经和外展神经。如果该病有肺炎或败血症，还可有脓胸、肺脓肿、心包炎、心内膜炎和脑脓肿。少数患者可反复发作，这是本病的特点之一。复发性脑膜炎患者往往有以下原因:①先天性解剖缺陷，如先天性筛状裂、先天性皮样窦、脑膜或脊膜膨出等。，细菌可以直接到达脑膜。②头部外伤，由于颅骨骨折(筛板骨折最常见)，发生脑脊液鼻漏，细菌从鼻咽部直接进入蛛网膜下腔。鼻腔分泌物中有糖说明鼻腔液中有脑脊液，可以进一步定量，或者椎管内注射亚甲蓝，观察鼻腔分泌物中是否有亚甲蓝。脑池发射型计算机断层扫描检查可用于确定脑脊液鼻漏和瘘，有利于进一步根治。无放射性核素检查时，可辅以头颅增强冠状CT扫描或颅底薄层CT检查，X线片也是重要的诊断方法。③脑膜旁有感染病灶，如慢性乳突炎或鼻窦炎。④宿主免疫缺陷，如先天性丙种球蛋白缺乏、免疫抑制剂和儿童期脾切除或脾萎缩，易导致复发性肺炎球菌脑膜炎。⑤脑脊液极稠，易形成粘连和脓包，影响药物疗效，也是复发原因之一。肺炎球菌脑膜炎的致死率保持在30%以上。

凡有肺炎、中耳炎、乳突炎、鼻窦炎、颅脑外伤、颅底骨折、脑部手术等病史，或有某些先天性缺陷的患者，如发热、头痛伴脑膜刺激征、颅内压增高等。，应考虑这种疾病的可能性。尤其是在冬春季肺炎的流行季节，以及婴幼儿和老年人。可靠的早期诊断方法是脑脊液检查。脑脊液呈脓性，有时含肿块，细胞数量和蛋白质含量增加，糖和氯化物减少。晚期病例，如脑脊液，出现细胞蛋白分离现象，提示蛛网膜下腔阻滞即将发生或已经发生。如果刺穿小脑延髓池，在引流的脑脊液中可见到大量脓细胞。脑脊液涂片中可见革兰氏阳性双球菌或短链球菌。如果脑脊液中有足够的细菌，可以用混合的肺炎球菌抗血清做荚膜肿胀试验，马上就能鉴定出是不是肺炎球菌。80%以上的脑脊液可培养获得病原菌。还可以通过流动免疫电泳找到特定的细菌抗原，从而快速做出诊断。脑脊液乳酸脱氢酶活性明显升高。脑脊液中有高浓度的TNF-2和IL-1β。采用PCR-核酸探针杂交技术检测脑脊液中的肺炎球菌，灵敏度高，可用于脑脊液培养阴性的辅助诊断。放射学检查可以是胸部透视或胸部X线，必要时可做鼻窦、乳突或筛板X线检查。如果从病史和临床表现(如视盘水肿)怀疑患者有局限性病变(如脑脓肿、硬膜下子宫积脓)，应做放射性核素检查、脑部CT、MRI或脑血管造影，尽早明确诊断。患有脑膜炎的婴儿应进行头颅x线检查和硬膜下穿刺，以便早期发现硬膜下积液。