大便出血引起肛门疼痛的原因如下:

1.肛门疼痛伴有便血。首先考虑肛裂的存在，肛门直肠的位置有皮肤黏膜组织。

2.不排除是因为内痔脱垂，粘膜组织受损后出血疼痛。

3.由于肛门直肠组织中的一些炎症性疾病，肛门直肠组织的粘膜出现充血、水肿和糜烂。排便时，在粪便的刺激和腹压增加的影响下，肛门部位会出现出血和疼痛。

建议患者到正规医疗机构进行局部肛门检查。诊断明确后，主要是通过药物治疗或手术治疗。