宝宝三个月后后脑勺有个坑。原因有很多，如下:

第一，可能是外伤或者手术造成的。如果一个孩子头部受伤，重重地摔了一跤，就会在后脑勺的这个部位造成凹陷性骨折。这种情况下，局部外观会有坑。有的宝宝还做了脑部手术，有缺陷就有坑。

第二，可能是先天问题造成的。如果宝宝有发育问题，没有完全闭合，这种情况下，后脑勺也会有一个坑。

第三，皮肤上也有炎症或感染性病变，局部水肿，按压时可能有一个坑。