肛门有肿块并伴有疼痛，可能由以下情况引起:

1.由肛周疾病引起，常见肛周脓肿、血栓性外痔，局部会有明显的红肿。可以考虑药物保守治疗或手术治疗。

2.肛门有肿块疼痛，也可能是肛瘘引起的。肛门附近会有持续的抽痛。大便困难时，脓性分泌物或血液会从瘘管流出。

3.肠道肿瘤，如直肠癌，也会导致肛门肿块和疼痛。

因此，如果发现肛门有肿块伴有疼痛，建议及时去医院，在医生的指导下进行检查，明确病因后再对症治疗。