肛门小肉芽的原因有很多，如下:

1.毛囊炎。久坐不动，裤子穿得太紧，出汗太多，与硬椅摩擦，引起毛囊炎，小红疹，伴有瘙痒，可外用消炎药膏，改善症状。

2、肛门湿疹。痔疮、肛瘘、肛周脓肿等肛门疾病。，引起肠液和分泌物流出肛门，造成肛周潮湿。反复刺激导致肛周湿疹，表现为红斑、丘疹、瘙痒等症状。

3、尖锐湿疣。这是一种由人乳头瘤病毒感染引起的增生性疾病。是一种性传播疾病，好发于外生殖器和肛门周围潮湿温暖的地方。