射精时的小肚子痛一般是指位于小腹的疼痛，可发生在中间或双侧腹股沟区。甚至可伴有会阴不适或尿频、尿急、尿痛，甚至血尿、血精。通常是由于生殖器官炎症，或器质性疾病引起的，主要有以下几个方面:

首先附睾炎，输精管感染可能会引起附睾炎，可导致双侧腹股沟甚至下腹部疼痛。

其次，精囊炎也会导致射精时小腹疼痛，并伴有血精、尿频、尿急等症状。

另外，前列腺炎会引起局部组织充血水肿，会影响前列腺神经的痛阈。射精时的一系列节律性收缩是对炎症病变的机械刺激，射精时常伴有剧烈疼痛。

最后是恶性肿瘤，男性泌尿生殖系统的恶性肿瘤，也可能引起射精痛。所以，在这种情况下，我们需要提高警惕，及时就医。