针对甲状腺的药物分为甲亢和甲减两大类。

治疗甲亢的药物分为咪唑类和嘧啶类，常见的有甲巯咪唑或丙基硫氧嘧啶。通过抑制甲状腺激素的合成，降低血液中甲状腺激素的水平，可以控制甲亢的治疗。

甲减的药物，主要是左甲状腺素钠或甲状腺素片。实际上是通过口服药物来补充或替代甲状腺激素的不足，从而纠正和治疗甲状腺功能减退。

另外，对于桥本甲状腺炎合并甲状腺功能减退的患者，有专家建议补充硒作为辅助治疗。