早上醒来后脑勺疼的原因有很多，主要有以下几种:

1.睡觉前或睡觉时有后脑勺损伤、头皮损伤、颅骨骨折、颅内挫伤，可能导致早上醒来后脑勺疼痛。

2.休息不足、睡眠不足、失眠也可能导致这种现象。

3.神经血管性头痛也可能导致你早上醒来时后脑勺疼痛。

4、局部头皮发炎，或颈椎病，或脑血管疾病。比如脑梗，脑出血，早上醒来后脑勺疼。