臀部两侧疼痛的原因如下:

首先，创伤性因素，如患者受到外力冲击或摔倒，导致臀部两侧肌肉充血肿胀，继而疼痛。

其次，患者做了大量的体育锻炼，或者重体力劳动导致臀部两侧肌肉酸痛。

再者，腰椎间盘突出或腰椎退行性疾病导致神经受压，从而出现疼痛症状。

另外，感染性疾病是由肛周疾病引起的，如肛周脓肿或直肠黏膜下脓肿。