RPGN是一种临床综合征，病因不同，其预后和治疗也不同。因此，除了与其他临床综合征相鉴别外，还需要对其病因进行鉴别诊断。

1.急性链球菌感染后肾炎初期，有链球菌感染史，对“O”的抵抗力高，少尿持续时间短(约2周)。极性补体C3大多下降，但随着病情的好转逐渐恢复。虽然早期可能会出现氮质血症，但大部分都能很快恢复。急性肾炎时，少尿持续时间长，C3不减，肾功能持续下降和恶化。肾活检主要显示新月体形成。病理变化主要是内皮细胞和系膜细胞增生以及多形核白细胞渗出。

2.溶血性尿毒症综合征多见于婴幼儿，主要表现为溶血性贫血、急性肾功能不全、血尿(或血红蛋白尿)，应与本病相鉴别。但贫血更严重，网织红细胞升高，外周红细胞形态异常。有破碎红细胞、头盔红细胞等多种异细胞，血小板减少，有明显出血倾向，有助于鉴别诊断。

3.继发性肾小球疾病如系统性红斑狼疮、过敏性紫癜、坏死性血管炎、肺出血性肾炎综合征等。均可引起急性肾炎，全身症状可能不明显或被忽视或掩盖，容易误诊。鉴别主要在于提高对原发病的认识，重视全身症状，对可能的原发病进行必要的检查，以明确诊断。