黄杆菌肺炎是一种条件致病菌，多发生于住院和精疲力尽的患者或重症监护室的危重患者。这些高危人群是黄杆菌肺炎临床预防的重点，尤其是呼吸机治疗、雾化吸入和气管内诊疗。气管内导管每日煮沸消毒1 ~ 2次，吸痰管一次性使用。呼吸机管道要定期清洗、浸泡、消毒，病房内空气要定期消毒。有时，医务人员或陪同人员会有黄色呼吸道。

一旦发生黄杆菌感染或流行，应密切隔离感染者，防止感染扩散。同时应进行流行病学调查。应对各种器械、病人分泌物、空气等进行反复细菌培养。，鉴定细菌菌株，指导临床防护和治疗。

长期大量使用广谱抗生素时，一定要注意体内菌群失调，防止机会致病菌趁机繁殖。因此，在没有明确指征的情况下，应避免长期使用广谱抗生素进行预防性治疗。对于大量使用肾上腺皮质激素和免疫抑制剂的患者，应特别注意预防此类致命感染的发生。

医院感染控制机构应定期对黄杆菌重点重症监护室和易感区域进行病原学检查和预测，对检出黄杆菌区域的各类器具和空气进行彻底消毒，防止感染。