目前还没有预防军团病的疫苗，只能通过早发现、早治疗、早预防的综合措施来控制。

1.针对环境因素的预防措施，重点针对冷却塔、水管网等可能导致军团菌繁殖和传播的固定设施的设计、维护和管理，制定相应的便于定期消毒和清洗的操作和实施办法。其次，卫生部门加强对区域内土壤和动物的军团菌监测，重点做好水源的监测和管理。冷却塔不使用时，应将水放掉，并定期用机械清洗去除水垢。供水系统消毒的方法主要有:提高水温(60℃)，定期冲洗供水管道，用含氯消毒剂消毒。

2.定期检查医院、酒店、歌舞厅、电影院、办公室等的水管网、空调、冷却塔水。定期检查军团菌污染情况，一旦发现立即消毒。

3.定期清洗家用空调，经常清洗空气过滤器。家用热水管、花洒、取暖器等可能残留水体的地方要定期清洗。

4.定期通风在使用空调的密闭空间，室内空气一定要定期开窗通风，不能一直关着窗户。

5.加强保健和锻炼，提高机体抵抗力，保护易感人群，尽量减少年老或体弱者到空气差的拥挤公共场所等一般防护措施。目前，应采取综合预防措施预防和控制军团菌病。